A Universidade de Beijing (UP) foi fundada em 1898 como produto da Reforma dos Cem Dias e da luta da nação chinesa pela salvação e sobrevivência e pela prosperidade com a educação revigorada. Originalmente conhecida como Universidade Imperial de Beijing, a UP foi a primeira universidade nacional abrangente da China moderna e foi renomeada para o seu nome atual em 1912, após a Revolução de 1911.

No longo curso civilizacional, a China antiga estabeleceu as instituições de ensino mais altas do país, incluindo a Academia Imperial, a Academia dos Filhos do Estado e a Escola dos Filhos do Estado, que tiveram um impacto importante na história da educação da China e do mundo. Herdando a ortodoxia da Academia Imperial e estabelecendo o iniciador das universidades, a UP não é apenas o herdeiro da veia cultural e da tradição educacional da China, mas também marca o início do ensino superior moderno do país. Além disso, na fase inicial, foi o órgão supremo de administração educacional do país e fez uma importante contribuição histórica para o estabelecimento do sistema académico moderno da China.

Como o centro do Movimento da Nova Cultura, o local de nascimento do Movimento de Quatro de Maio, a origem da disseminação do marxismo e dos pensamentos de ciência e de democracia na China e a base inicial importante das atividades do Partido Comunista da China (PCCh), a UP fez contribuições extraordinárias para a revitalização e a libertação da nação, a construção e o desenvolvimento do país e a civilização e o avanço da sociedade, além de ter desempenhado um importante papel de vanguarda no processo de modernização da China. Na UP, o espírito de patriotismo, progresso, democracia e ciência e a atmosfera académica de diligência, rigor, objetividade e criatividade têm estado vivos e têm sido transmitidos de geração em geração.

Em 1917, Cai Yuanpei, um famoso educador, assumiu o presidente da UP. Ele seguiu o princípio de liberdade de pensamentos e a doutrina de inclusão e realizou reformas frutíferas da UP, o que contribuiu para a emancipação mental e a prosperidade académica. Várias figuras proeminentes lecionaram ou trabalharam na UP, tais como Chen Duxiu, Li Dazhao, Mao Zedong, Lu Xun, Hu Shi e Li Siguang.

Após o Incidente da Ponte Marco Polo em 1937, a UP, a Universidade Tsinghua e a Universidade Nankai mudaram-se para Changsha, no sul da China, e formaram em conjunto a Universidade Nacional Provisória de Changsha. Em 1938, esta universidade mudou-se para Kunming, no oeste da China, e foi renomeada como Universidade Nacional Associada do Sudoeste. Após a vitória chinesa na Guerra de Resistência contra a Agressão Japonesa, a UP foi desmobilizada em outubro de 1946 em Beijing.

Após a implantação da República Popular da China, as instituições do ensino superior de todo o país passaram por uma reorganização em 1952. Neste contexto, a Universidade de Beijing tornou-se uma universidade abrangente, com foco no ensino fundamental e na pesquisa nas humanidades e ciências, bem como em disciplinas aplicadas de fronteira, cultivando um grande número de talentos excecionais para a causa da construção socialista. Entre os 23 cientistas contribuintes para o projeto “Duas bombas, um satélite”, existem 12 ex-alunos da UP.

Com a reforma e abertura da China, a UP entrou num novo período de desenvolvimento rápido e estável e tornou-se uma das primeiras universidades do "Projeto 211" nacional em 1994. Em 4 de maio de 1998, na conferência para a celebração do 100º aniversário da UP, o Comité Central do PCCh declarou que para alcançar a modernização, o nosso país precisava de dispor de várias universidades qualificadas de proeminência mundial. Depois, foi lançado o "Projeto 985" destinado à construção de universidades de classe mundial. Com o apoio e a promoção dessa estratégia nacional, a UP virou uma nova página de desenvolvimento.

Em 3 de abril de 2000, a UP fundiu-se com a antiga Universidade Médica de Beijing (UMB) para formar a nova UP. O antecessor da antiga UMB foi a Escola Nacional de Medicina de Beijing (ENMP) fundada em 26 de outubro de 1912 e o estabelecimento desta escola nacional de medicina ocidental foi alicerçado pela a clínica médica estabelecida em 1903 pela Universidade Imperial de Beijing. Nas décadas de 1930 e 1940, a ENMP era conhecida como Escola Médica da Universidade de Beiping e foi integrada na UP em julho de 1946. Na reorganização do ensino superior chinês em 1952, a Escola Médica da UP foi separada da UP e tornou-se uma instituição independente chamada Faculdade Médica de Beijing que foi renomeada como UMB em 1985 e que se tornaria uma das primeiras universidades médicas com apoio prioritário do "Projeto 211" nacional em 1996. A fusão entre a UP e a antiga UMB alargou ainda mais a estrutura disciplinar da UP e preparou as bases para o cruzamento da medicina com as ciências, a engenharia e as ciências humanas e sociais e para a reforma e a inovação da educação médica.

Desde o 18º Congresso Nacional do PCCh, sob a forte liderança do Comité Central do PCCh com o camarada Xi Jinping no núcleo, a UP tem acelerado o desenvolvimento conotativo de alta qualidade e tem feito novos avanços na nova jornada de construção de uma universidade de classe mundial com características chinesas. Em 2 de maio de 2018, o Secretário-Geral do Comité Central do PCCh, Xi Jinping, realizou uma visita à UP e apontou no simpósio de professores e estudantes: “Nos últimos anos, a UP tem herdado a gloriosa tradição e tem aderido à orientação socialista na gestão académica, tendo obtido resultados frutuosos na promoção das virtudes com a educação, na construção no âmbito do Plano Universitário Duplo de Primeira Classe e no serviço do desenvolvimento económico e social. Com ideias claras sobre o desenvolvimento, a prestação académica e a influência da UP aumentaram significativamente. É gratificante ver tudo isso.” Com o encorajamento e a orientação do Secretário-Geral do Comité Central do PCCh, Xi Jinping,  a UP continuará a fazer esforços e lutar com persistência, insistindo em ser um berço para a cultivação de talentos inovadores de qualidade excecional, uma posição importante para a criação de ciência e tecnologia de ponta e de pensamentos e culturas avançados, uma plataforma central para o serviço do desenvolvimento de alta qualidade do país e uma ponte para a promoção da abertura de alto nível ao exterior, escrevendo constantemente novos capítulos da construção de uma universidade de classe mundial com características chinesas na nova jornada.

O atual secretário do Comité do PCCh da UP é o Hao Ping e o atual reitor da UP é o Gong Qihuang.